Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms