Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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