Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
NischQ80TM9 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NischQ80TM9 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms