Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg9aQ68FE2 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms