Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms