Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Shank3Q4ACU6 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms