Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms