Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ctdnep1Q3TP92 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms