Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms