Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Nedd1P33215 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Nedd1P33215 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Nedd1P33215 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Nedd1P33215 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Nedd1P33215 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Nedd1P33215 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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Nedd1P33215 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Nedd1P33215 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms