Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RxraP28700 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RxraP28700 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RxraP28700 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RxraP28700 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RxraP28700 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RxraP28700 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RxraP28700 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RxraP28700 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RxraP28700 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RxraP28700 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RxraP28700 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RxraP28700 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RxraP28700 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RxraP28700 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RxraP28700 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RxraP28700 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RxraP28700 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RxraP28700 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RxraP28700 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RxraP28700 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms