Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PdgfrbP05622 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 504.1 ms