Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms