Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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