Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Trpm6-201ENSMUST00000040489 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PtprbB2RU80 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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PtprbB2RU80 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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PtprbB2RU80 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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PtprbB2RU80 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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PtprbB2RU80 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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PtprbB2RU80 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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PtprbB2RU80 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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PtprbB2RU80 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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PtprbB2RU80 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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PtprbB2RU80 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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