Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.6 ms