Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms