Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc47Q9D024 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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