Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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