Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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