Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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