Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Gm28047Q3US59 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Gm28047Q3US59 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms