Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms