Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms