Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccbe1Q3MI99 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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