Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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