Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms