Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprmP28828 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms