Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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H2-Eb1P04230 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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H2-Eb1P04230 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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H2-Eb1P04230 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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H2-Eb1P04230 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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H2-Eb1P04230 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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H2-Eb1P04230 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
H2-Eb1P04230 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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