Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc180J3QNE4 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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