Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Srp54bE9PXC0 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Srp54bE9PXC0 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Srp54bE9PXC0 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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