Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rrn3B2RS91 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms