Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.5 ms