Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms