Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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