Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rprd1bQ9CSU0 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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