Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms