Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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