Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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