Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm28047Q3US59 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms