Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm7546-202ENSMUST00000211354 275 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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Znf48Q3US17 Tprkb-201ENSMUST00000067137 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Trappc12-202ENSMUST00000168129 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Znf48Q3US17 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Znf48Q3US17 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Znf48Q3US17 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Znf48Q3US17 Gpbp1-202ENSMUST00000091236 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Znf48Q3US17 Gm38947-201ENSMUST00000209940 2720 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Znf48Q3US17 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Znf48Q3US17 Fignl1-201ENSMUST00000047689 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Znf48Q3US17 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm14267-208ENSMUST00000228324 1189 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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