Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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