Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms