Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VdrP48281 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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