Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SrprbP47758 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SrprbP47758 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms