Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cd28P31041 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms