Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RxraP28700 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RxraP28700 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RxraP28700 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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