Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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P10404 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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P10404 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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P10404 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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P10404 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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P10404 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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P10404 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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P10404 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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P10404 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
P10404 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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P10404 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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P10404 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
P10404 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
P10404 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
P10404 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
P10404 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
P10404 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
P10404 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
P10404 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
P10404 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
P10404 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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