Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccdc180J3QNE4 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccdc180J3QNE4 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccdc180J3QNE4 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccdc180J3QNE4 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccdc180J3QNE4 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccdc180J3QNE4 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccdc180J3QNE4 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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