Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm20830J3KML6 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms